“十一五”期间，舟山港域加大基础设施投资力度，进一步提升基础设施配套能力，共完成港口航道、锚地等基础设施投资近10亿元。建成包括虾峙门口外30 万吨级航道、马岙港区公共航道和嵊泗、马岙、六横等引航基地，以及虾峙门口外航道配套锚地、野鸭山锚地等共10大锚地、总面积178.24平方公里。同时，舟山港航EDI系统功能进一步完善，完成港航EDI中心与海关、国检、浙江电子口岸及大浦口集装箱码头等单位专线接入工作；舟山港航国际大厦（暂名）开工建设；舟山港域无动力船舶防台浮筒试验工程列入浙江省科技厅重大科技攻关项目，首期3个防台浮筒成功抛设。